LMI Pathobios

FORMATION MYCOMOL

Outils de diagnostic moléculaire et de caractérisation de la diversité des bioagresseurs des plantes
Contexte et justification :

L’objectif global de cette formation est de contribuer au renforcement des capacités sur l’utilisation de nouvelles technologies de diagnostic et de caractérisation de la diversité génétique des bioagresseurs fongiques.

Objectifs spécifiques :
  1. Rappeler quelques bases théoriques nécessaires à la mise en œuvre des outils de diagnostic et de caractérisation de la diversité des bioagresseurs fongiques: structure des génomes, types de marqueurs génétiques, bases théoriques des méthodes de diagnostic moléculaire, etc.
  2. Mettre en pratique les outils de diagnostic moléculaire et de caractérisation de la diversité des bio-agresseurs : extraction d’ADN, amplification et révélation, séquençage ou génotypage
  3. Interpréter et exploiter les données produites: analyse de produits de séquençage, alignement de séquence, analyse de polymorphisme, mesure de diversité, analyse de la structure des populations.

Résultats attendus :

A l’issue de la formation, les connaissances théoriques des stagiaires seront renforcées sur les outils de diagnostic et d’analyse de la diversité des populations d’un bio agresseur.

Les stagiaires pourront eux même exécuter les différentes étapes des techniques appliquées au diagnostic et à l’étude de la diversité des populations de bioagresseurs.

Les stagiaires auront une formation de base pour interpréter et exploiter les résultats obtenus.

Organisateurs :
UNB, INERA, IRD, LMI Patho-Bios
Equipe pédagogiquecipants:
Cirad, INERA, IRD, LMI Patho-Bios.

Lundi 11 Juin 2018

Accueil, présentation des objectifs de la formation et rappels théoriques en biologie moléculaire

Mardi 12 Juin 2018

Manipulations pratiques : Extraction d’ADN fongique

Mercredi13 juin 2018

Manipulations pratiques : PCR et révélation sur gel d’agarose

Jeudi 14 Juin 2018

Analyse des données (séquences d’ADN et microsatellites)

Vendredi 15 Juin 2018

Analyse des données (séquences d’ADN et microsatellites) et bilan de la formation

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